Pliki i scratch

Dla zadań lokalnych wejścia mogą znajdować się w lokalnym katalogu użytkownika. Dla global katalog obliczenia musi być w /shared/$USER/... i być dostępny na docelowej maszynie.

ORCA przez qjob liczy w unikalnym, prywatnym katalogu pod /scratch/qjob. Wejście jest kopiowane; %pal jest synchronizowane w kopii, a oryginalny plik pozostaje bez zmian.

Wyniki wracają do katalogu wejścia. Po udanym obliczeniu i zwróceniu wyników scratch jest domyślnie usuwany. Po błędzie pozostaje; jego ścieżkę znajdziesz w slurm-NUMER.out.

Orca --clean-tmp false -c 4 -m 8 molecule.inp
Orca -B '*' -c 4 -m 8 molecule.inp

Pierwszy przykład zachowuje scratch także po sukcesie. Drugi rozszerza zestaw kopiowanych wyników. Domyślne kopiowanie obejmuje m.in. .gbw, .hess, .cis, geometrie i widma; pełną listę pokazuje Orca -h.

Opcja --storage local:... nie rezerwuje przestrzeni dyskowej ani nie nakłada tu limitu dyskowego. Sprawdzaj wolne miejsce:

df -h /scratch /shared

Nie usuwaj scratch działającego zadania. Nazwy wejść ORCA powinny zawierać tylko litery, cyfry oraz _, ., +, -; unikaj spacji.