qjob

qjob przygotowuje skrypt zadania i przekazuje go do Slurma. Kod wspólny znajduje się w /opt/qjob, a ustawienia bose w /etc/qjob. Użytkownik uruchamia polecenia bez sudo.

Na bose potwierdzono wspólne polecenia Orca, sq i qglobal. Obecność wrapperów innych aplikacji w repozytorium qjob nie oznacza, że są skonfigurowane na bose.

Najczęściej używane opcje Orca

Opcja	Znaczenie	Domyślnie na bose
-c N	Liczba procesów na maszynie	4
-n N	Liczba maszyn	1; maksymalnie 1
-m GB	Łączna pamięć na maszynę, całkowite GB	8
-t H	Czas rzeczywisty w godzinach; także D-HH:MM:SS	24
-p NAZWA	Partycja lub dispatcher global	bose
-v WERSJA	Wersja ORCA	6.1.1
--debug	Wyświetl skrypt bez zgłaszania	wyłączone
--clean-tmp false	Zachowaj scratch także po sukcesie	domyślnie sprzątanie po sukcesie
-C 'PLIKI'	Dodatkowe pliki kopiowane do scratch	brak
-B 'PLIKI'	Pliki zwracane do katalogu wejścia	wybrane wyniki

-n nie oznacza liczby procesów. -m nie oznacza wartości %maxcore w MB. To istotne przy przenoszeniu poleceń ze starych skryptów.

Przykłady

Orca -c 8 -m 24 -t 12 molecule.inp
Orca --debug -c 8 -m 24 molecule.inp
Orca -c 4 -m 8 -t 2 *.inp
Orca --clean-tmp false -c 4 -m 8 molecule.inp
Orca -B '*' -c 4 -m 8 molecule.inp
Orca -h

Każdy plik w *.inp tworzy osobne zadanie. -B '*' może zwrócić dużo danych; upewnij się, że masz miejsce. %b w listach plików oznacza nazwę wejścia bez rozszerzenia.

Ustawienia

Typowa konfiguracja użytkownika znajduje się w ~/.config/qjob/qjob.conf i ~/.config/qjob/orca.conf. Opcje polecenia mają najwyższy priorytet. Pliki .conf zawierają kod powłoki; korzystaj wyłącznie z zaufanej konfiguracji.

Na bose wrapper ogranicza zadanie do 32 fizycznych rdzeni i 488 GB pamięci. To limity qjob; nie są deklaracją wolnych zasobów ani pełnym opisem konfiguracji Slurma.